3章 RINGSツールを利用するために

rings

RINGS (Resource for Informatics of Glycomes at Soka) とは糖鎖(構造)解析のためのリソー スです。RINGS では、糖鎖を認識するタンパク質などが糖鎖のどの部分を認識しているかを予測するためのツールや、糖鎖間の共通部分木を探すツールなど、糖鎖解析に用いられる様々なツールが提供されています。主に、質量分析などの糖鎖構造プロファイルデータが手元にある仮定で開発されてきましたが、今後はある糖鎖構造情報から関連する遺伝子やタンパク質、修飾部位などの情報も調べられるようなツール開発も計画しています。

RINGSのツールを利用して糖鎖解析を行うのに必要な基礎知識をこの章で説明します!

1 糖鎖構造情報の表し方

2 糖鎖のアラインメント

3 カーネル分類法

4 ノックアウト実験

5 糖鎖アレイ

6 質量分析・MS/MS解析